2006-2007 sezonunda Atina’da düzenlenen Final Four’da şampiyonluğu kazanan Panathinaikos, bir sonraki yıl bu bağlamda modern dönemin ilk örneği oldu. O zaman şu ankinden farklı formatta oynanan organizasyonda normal sezon grubunu lider bitirmesine rağmen Son 16 grubunda Montepaschi Siena ve Partizan’ın gerisinde kalan Zeljko Obradovic yönetimindeki Yunan ekibi, play-off aşamasında boy gösterme şansını elde edemedi.