Obradovic daha önce başarılar yakalamıştı ancak kariyerinin dönüm noktası kuşkusuz Yunan ekibi Panathinaikos’a transferi oldu. Koç, ekibindeki yetenekli oyuncularla Avrupa’ya ambargo koydu. Tecrübeli başantrenör bu 13 yıla beş EuroLeague şampiyonluğu, 11 Yunanistan Basketbol Ligi şampiyonluğu, yedi Yunanistan Basketbol Kupası şampiyonluğu, bir kez EuroLeague üçüncülüğü ve bir kez Euroleague dördüncülüğü sığdırdı.
Diamantidis ve İbrahim Kutluay gibi isimlerin koçluğunu yapan Obradovic, başarılı yılların etkisiyle taraftarın sevgilisi oldu. 2007 ve 2011 yıllarında EuroLeague’de “Yılın Koçu” ödülüne layık görüldü.
