Yunan general Nikos Zisis, profesyonel kariyeri Yunan takımı olan AEK ile başladı. Boyunun oldukça uzun olmasına rağmen oyun kurucu ve şutör gard gibi mevkilerde de oynama kapasitesine sahipti ve bu da onu henüz kariyerinin başında özel bir isim haline getirdi.
2001 yılında Yunanistan’ın en genç oyuncusu ödülünü kazandı. 2005 yılında Legabasket Serie A ve EuroLeauge takımlarından Benetton Traviso’ya transfer oldu. 13 Haziran 2007 yılında Rus takımı CSKA Moskova ile anlaşma sağladı ve 2007-08 Euroleauge şampiyonluğunu aldı. Oynadığı her takımda fark yaratmasıyla ön plana çıkan Zisis 29 Aralık 2014 tarihinde temsilcimiz Fenerbahçe Ülker ile oyuncu kurucu pozisyonunda anlaşma sağladı ve burada da unutulmaz izler bıraktı. Ayrıca en yakın arkadaşı Yunan milli takımında da beraber oynadığı Vassilis Spanoulis’ti.