PAO dönemi çok hızlı başladı Obradovic’in. Bodiroga gibi bir lideri de bulan Obradovic, takımı ikinci senesinde de hemen Final Four’a soktu.Paris’teki turnuvanın yarı finalinde rakip yine temsilcimiz Efes Pilsen’di. Sonuç değişmedi ve Yeşiller finale kaldı.
Finaldeki rakip yine Maccabi Tel Aviv’di. Ancak bu sefer Pini Gershon kupaya tutanacaktı. Maçı 81 – 67 kaybeden Panathinaikos seneyi ikinci sırada bitirdi.